Isolation and identification of Salmonella spp. in raw milk from dairy herds in Colombia / Isolamento e identificação de Salmonella spp. no leite cru de rebanhos leiteiros na Colômbia

Salmonellosis is a foodborne disease (FBD) that affects public health and can cause death in people. Many outbreaks of Salmonellosis have been reported due to the contamination of raw milk and dairy products with the pathogen. To determine the prevalence of Salmonella spp. in milk samples from four dairy herds in the Sabana of Bogotá in 2017, 112 milk samples were taken directly from the mammary gland during milking. All milk samples were cultured and tested to isolate and identify Salmonella spp. using microbiological and molecular methods. Salmonella spp. prevalence of milk samples was found to be 20.5% (n=23). The main Salmonella serovars isolated were S. Newport (60.87%), S.Typhimurium (17.4%), S. Virchow, S. Bredeney, and S. Anatum (4.3% each one of the serovars). However, it was not possible to determine the Salmonella serotype in two isolates. The prevalence of Salmonella spp. in milk has not been studied extensively in Colombia. The 20.5% in the prevalence might be due to fact that the sample was taken directly from the mammary gland allowing a better chance of isolation by avoiding the dilutional effect of mixed milk from different cows in the buckets. This also suggests that the infection of the udder could have occurred by hematogenous dissemination or by milking machine contamination. This study highlights the need to implement measures to prevent contamination and reduce the problem in the herds, which will result in milk and dairy products with high standards of innocuity and quality and decrease the risk of foodborne illness(AU)

A salmonelose é uma doença transmitida por alimentos que afeta a saúde pública e pode causar a morte de pessoas. Muitos surtos de salmonelose têm sido relatados devido à contaminação de leite cru e produtos lácteos com o patógeno. Para determinar a prevalência de Salmonella spp. em amostras de leite de quatro rebanhos leiteiros na Sabana de Bogotá em 2017, cento e doze amostras de leite foram colhidas diretamente da glândula mamária durante a ordenha. Todas as amostras de leite foram cultivadas para isolar e identificar Salmonella spp. usando métodos microbiológicos e moleculares. A prevalência de Salmonella spp. nas amostras de leite foi de 20,5% (n = 23). Os principais sorovares de Salmonellaidentificados foram S. Newport (60,87%), S. Typhimurium (17,4%), S. Virchow, S. Bredeney e S. Anatum (4,3% cada um dos sorovares). No entanto, não foram determinados os sorovares de dois isolados. A prevalência de Salmonella spp. no leite ainda não foi extensivamente estudada na Colômbia. Os 20,5% na prevalência podem ser devidos ao fato de a amostra ter sido colhida diretamente da glândula mamária, permitindo uma melhor chance de isolamento, evitando o efeito de diluição do leite misto de diferentes vacas nos baldes, o que pode indicar infecção do úbere pela disseminação hematogênica ou por contaminação da ordenhadeira. Este estudo destaca a necessidade da implementação de medidas destinadas a prevenir a contaminação e reduzir o problema nos rebanhos, resultando em leite e produtos lácteos com altos padrões de inocuidade e qualidade, diminuindo o risco de doenças de origem alimentar.(AU)

Genotyping of Malassezia pachydermatis disclosed genetic variation in isolates from dogs in Colombia / Genotipagem de Malassezia pachydermatis revelou variação genética em isolados de cães na Colômbia

Malassezia pachydermatis is a lipophilic and lipid-dependent yeast mostly isolated from animals' skin; hence, it is regarded as a zoophilic species causing otitis externa in dogs. Aspects associated with its epidemiology and pathogenicity is a matter of interest. This study aimed to conduct a molecular characterization of 43 isolates of M. pachydermatis obtained from dogs with otitis externa. For this purpose, the 5.8S internal transcribed spacer 2 (ITS2) and D1/D2 26S rRNA regions were amplified, sequenced and analyzed using restriction fragment length polymorphism (RFLP) with AluI, CfoI, and BstF5I endonucleases. Phylogenetic analyses revealed that these isolates grouped with the sequence types I, IV and V, previously proposed for M. pachydermatis. Interestingly, we found a new polymorphic RFLP pattern using BstF5I, these isolates were associated with the sequence types IV and V, nevertheless an association between polymorphic RFLP patterns, and fosfolipase activity or canine population data was not observed. These findings underline the genetic diversity of M. pachydermatis and provide new insights about the epidemiology of this species in the analyzed population.(AU)

Malassezia pachydermatis é uma levedura lipofílica e dependente de lipídios, principalmente da pele de animais. Sendo, por essa razão, considerada uma espécie zoofílica e causadora de otite externa em cães. Neste sentido, aspectos associados à sua epidemiologia e patogenicidade constituem um tema de interesse científico. O objetivo deste estudo foi realizar a caracterização molecular de 43 isolados de M. pachydermatis obtidos a partir de cães com otite externa. Para esta propósito, foram amplificadas, sequenciadas e analisadas com enzimas de restrição as regiões do gene 5.8S, do espaçador interno transcrito 2 (ITS2) e D1/D2 do 26S do rRNA pelo método RFLP, com as endonucleases AluI, CfOI e BstF5I. Análises filogenéticas revelaram que os isolados se agruparam com as sequências tipo I, IV e V de M. pachydermatis como já descrito anteriormente. De maneira interessante, se observou um novo RFLP polimórfico utilizando BstF5I. Os isolados que mostraram esse padrão foram associados com os padrões IV e V. No entanto, não foi observada associação entre padrões polimórficos de RFLP e atividade de fosfolipase ou dados da população canina. Estes resultados demonstram a diversidade genética de M. pachydermatis e fornecem novas perspectivas sobre a epidemiologia destas espécies na população analisada.(AU)

Estimación de la prevalencia de Salmonella spp. en pechugas de pollo para consumo humano provenientes de cuatro localidades de Bogotá- Colombia / Prevalence of Salmonella spp. in chicken breasts for human consumption in four districts in Bogotá - Colombia

Objetivo: Determinar la prevalencia de Salmonella spp. en muestras de pechugas de pollo para consumo humano en diferentes localidades de Bogotá. Materiales y métodos: Se obtuvieron 72 muestras en tiendas y plazas de mercado de 4 localidades de la ciudad. Las muestras fueron procesadas por métodos microbiológicos y moleculares estandarizados para la detección e identificación de Salmonella spp. Resultados: La prevalencia estimada para Salmonella spp. fue del 29.2% (n=21), de las cuales el 52.4% (n=11) fueron obtenidas a partir de muestras de tiendas y el 47.6% (n=10) de las muestras de plazas de mercado. Los serovares identificados con mayor frecuencia fueron Salmonella enterica group IIIb, S. Bredeney y S. Virchow. Las localidades con mayor presencia del patógeno fueron Usaquén y Fontibón. Discusión: Estudios realizados en Colombia reportan una prevalencia del 27% para Salmonella spp. en muestras de carcasas completas, lo que coincide con lo observado en este estudio, esto podría asociarse con inadecuadas condiciones de manejo y/o almacenamiento del producto. Conclusión: Se determinó la presencia de Salmonella spp. en las muestras de pechugas de pollo evaluadas, lo que implica un riesgo potencial para la salud pública, por lo que es necesario ampliar este tipo de estudios para conocer la situación real a nivel nacional frente a este patógeno.

Objective: To determine the prevalence of Salmonella spp. in chicken breasts for human consumption in four different districs in Bogotá. Materials and Methods: Seventy two samples were collected from different convinience stores and market places in the city. All the samples were processed using standarized microbiological and molecular methods to isolate and identify Salmonella spp. Results: The determined prevalence of Salmonella spp. was 29.2% (n=21), out of vwhich 52.4% (n=11) were obtained from convinience stores and 47.6% (n=10) from market places. The identified serovars were Salmonella enterica group IIIb, S. Bredeney and S. Virchow. The districs with highest prevalence of the pathogen were Usaqén and Fontibón Discussion: Previous studies done in Colombia have reported prevalence of Salmonella spp. around 27% in chicken carcasses, this is very similar to the prevalence observed in this study; these findings could be due to inadequate handling and storage practices of the product. Conclusion: The presence of Salmonella spp. was determined in the studied samples; this finding indicates the potential public health risk. These results demand further studies in countrywide base to determine the actual situation of this pathogen.

Detección e identificación de Salmonella spp. en huevos para consumo humano, provenientes de diferentes localidades de Bogotá, Colombia, 2015 / Salmonella spp. isolation and identification in eggs for human consumption from different urban areas in Bogotá, Colombia, 2015

Objetivo: Determinar la prevalencia de Salmonella spp. en muestras de huevos para consumo humano en localidades de Bogotá. Materiales y métodos: Se obtuvieron 96 muestras en tiendas y plazas de mercado de 4 localidades de la ciudad. Se procesó de forma separada la cáscara y el contenido interno mediante métodos microbiológicos y moleculares para aislamiento e identificación Salmonella spp. Resultados: Se determinó una prevalencia total de Salmonella spp. de 9,4% (n=9), de ésta el 55% (n = 5) provenían del contenido interno y 44% (n = 4) de cáscara, sin embargo no se logró tipificar el serovar de Salmonella enterica presente. Las localidades con mayor presencia del patógeno fueron Usaquén y Fontibón. Discusión: Estudios realizados en Colombia evidencian bajas prevalencias de Salmonella spp. (0 -1,74%) en muestras de huevos, sin embargo los hallazgos de este estudio evidencian una mayor recuperación, lo que podría asociarse con inadecuadas condiciones de manejo y/o almacenamiento del producto. Conclusión: Se estableció la presencia de Salmonella spp. en las muestras de huevo evaluadas, lo que implica un riesgo potencial para la salud pública, por lo que es necesario ampliar este tipo de estudios para conocer la situación real a nivel nacional frente a este patógeno.

Objective: To determine the prevalence of Salmonella spp presence in eggs for human consumption in urban areas in Bogota. Materials and methods: 96 samples were collected from convenience stores and markets in 4 urban areas in the city. The eggshells were separated from the egg's internal content and both were processed separately using microbiological and molecular techniques to isolate and identify Salmonella spp. strains. Results: A Salmonella spp. prevalence of 9.4% (n=9) was found. Salmonella spp was isolated from the egg's internal content in 55% (n=5) of samples and 44% (n=4) from the eggshells. The Salmonella enterica serovar could not be identified. The pathogen was more frequently isolate in samples from Usaquén and Fontibón urban areas. Discussion: Studies of Salmonella spp. prevalence in eggs done in Colombia have shown it to be low (0-1.74%); However, this study determined a higher prevalence. These results suggest that inadequate handling/storage conditions could have been associated with them. Conclusion: Salmonella spp. was isolated from the egg samples from 4 different urban areas in Bogotá. These findings suggest the existence of a public health risk; therefore, there is a need to perform wider and more complete studies to determine the actual situation of Salmonella ssp. egg contamination in the country.

Determination of presence of Tritrichomonas foetus in uterine lavages from cows with reproductive problems / Determinação da presença de Tritrichomonas foetus em lavados uterinos de vacas com problemas reprodutivos

The aim of this study was to determine the presence of Tritrichomonasfoetus in two dairy herds on the Altiplano Cundiboyacense. Twenty-one low-volume uterine lavages from cows with a history of reproductive problems in two dairy herds located in the municipality of Sibaté (Cundinamarca) and Ventaquemada (Boyacá) were evaluated. In the first herd, 10 cows were sampled and in the second, 11 cows, based on three inclusion criteria. The uterine lavages were obtained through infusion of physiological saline solution into the uterine body. The samples were centrifuged and seeded in Tritrichomonas basal medium for 10-15 days at 37 ºC. The protozoa were evaluated on the day of sampling and 10 and 15 days after incubation by means of direct viewing under a dark-field microscope. Positive samples were stained with Wright and Lugol to identify the morphological characteristics. This study showed that T. foetus was present in 61.8% of the animals sampled. The determination that T. foetus was present in 61.8% of the samples analyzed is a significant finding given that in the herds evaluated, this agent had not previously been diagnosed.

O objetivo do presente estudo, foi determinar a presença de Tritrichomonas foetus em dois rebanhos leiteiros no Altiplano Cundiboyacense. De vacas com um histórico de problemas reprodutivos, foram avaliados 21 lavados uterinos de pequeno volume, em dois rebanhos leiteiros localizados nos municípios de Sibaté (Cundinamarca) e Ventaquemada (Boyacá). No primeiro rebanho, 10 vacas foram amostradas e no segundo 11, baseado em três critérios de inclusão. Os lavados uterinos foram obtidos mediante infusão de solução salina fisiológica no corpo do útero. As amostras foram centrifugadas e semeadas em meio de cultura básico para Tritrichomonas por 10-15 dias a 37 ºC. Os protozoários foram avaliados no dia da colheita de amostras e 10 e 15 dias após incubação por meio de visualização direta sob um microscópio de campo escuro. As amostras positivas foram coradas com Wright e Lugol para identificar as características morfológicas. Este estudo mostrou que T. foetus estava presente em 61,8% dos animais amostrados. A determinação de que T. foetus estava presente em 61,8% das amostras analisadas é um achado significativo, dado que nos rebanhos avaliados, esse agente não tinha sido previamente diagnosticado.

Análisis retrospectivo (2009-2010) de las alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas con diagnóstico clínico presuntivo de micosis en caninos y felinos / Análise retrospectiva (2009-2010) das alterações dermatológicas, óticas e oftalmológicas com diagnóstico clínico presuntivo de micose em cães e gatos / A retrospective analysis (2009-2010) of the dermatological, ear and ophtalmological alterations with presumptive clinical diagnosis of mycosis in canines and felines

Objetivo. Determinar la prevalencia de las alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas clínicamente presuntivas de ser causadas por hongos y analizar demográficamente su presentación. Materiales y métodos. Se realizó un estudio retrospectivo en una clínica para pequeños animales en Bogotá; se revisaron historias clínicas de pacientes que consultaron por alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas durante 2009 y 2010. Resultados. En el período evaluado la prevalencia de las alteraciones dermatológicas en caninos fue de 7,8%, las óticas de 4,2% y las oftalmológicas de 3,3%. Dentro de las alteraciones dermatológicas, la sospecha etiológica principal por diagnóstico clínico fueron los dermatofitos con 86,9%, en las alteraciones óticas fue Malassezia con 86,5% y para las oftalmológicas fue Candida con 83,3%. El análisis estadístico de variables no mostró asociación con los síntomas ni con los agentes etiológicos diagnosticados clínicamente; sin embargo, la evaluación categorizada evidenció asociaciones entre razas y edades con las etiologías por diagnóstico clínico. El diagnóstico de las etiologías micóticas se estableció en la mayoría de los casos por hallazgos clínicos y con menor frecuencia por raspado de piel y citología ótica; en ninguno de los casos se realizó cultivo micológico. La población felina no presentó alteraciones dermatológicas, óticas y oftalmológicas clínicamente compatibles con etiología fúngica. Conclusión. En caninos, la prevalencia de las alteraciones dermatológicas clínicamente compatibles con dermatofitos fue de 86,9%, los procesos óticos asociados con Malassezia de 86,5% y los oftalmológicos sospechosos de Candida con 83,3%. Los diagnósticos definitivos se establecieron por hallazgos clínicos sin la realización de metodologías diagnósticas estándar como el cultivo...

A retrospective analysis (2009-2010) of the dermatological, ear and ophtalmological alterations with presumptive clinical diagnosis of mycosis in canines and felines. Objective. To determine the prevalence of dermatological, ear and ophthalmological alterations clinically presumptive to be caused by fungi and to analyze their occurrence demographically. Materials and methods. We carried out a retrospective study in a clinic in Bogota for small animals. We reviewed the medical histories of patients who requested medical appointments due to dermatological, ear and ophtalmological alterations in 2009 and 2010. Results. In the assessed period, the prevalence of dermatological alterations in dogs was of 7.8%, 4.2% of ear alterations and of 3.3% of ophtalmological alterations. The main etiological suspects through clinical diagnosis were: dermatophytes with an incidence of 86.9% among dermatological alterations, Malassezia with an 86.5% of incidence in ear alterations, and Candida with 83.3% of incidence in ophtalmological alterations. Statistical analysis of variables showed no association with symptoms or clinically diagnosed etiological agents, but the categorized evaluation showed associations of races and ages with the etiologies through clinical diagnosis. The diagnosis of fungal etiologies was accomplished in most cases by clinical findings and less frequently by skin scrapings and ear cytology; in none of the cases a mycological culture was done. The feline population showed no dermatological, ear or ophtalmological alterations compatible with a fungal etiology. Conclusion. In canines, the prevalence of dermatological alterations clinically compatible with dermatophytes was of 86.9%; ear alterations associated with Malassezia were of 86.5%; and ophtalmological alterations Candida-suspected were 83.3%. Final diagnoses were accomplished with the help of clinical findings without following standard diagnostic methodologies such as cultivation...

Análise retrospectiva (2009-2010) das alterações dermatológicas, óticas e oftalmológicas com diagnóstico clínico presuntivo de micose em cães e gatos. Objetivo. Determinar a prevalência das alterações dérmicas, óticas e oftálmicas clinicamente presuntivo de serem causadas por fungos e analisar demograficamente sua apresentação. Materiais e métodos. Foi realizado um estudo retrospectivo numa clínica para pequenos animais em Bogotá; foram revisadas as histórias clínicas de pacientes com alterações dérmicas, óticas e oftalmicas em 2009 e 2010. Resultados. Durante o período de avaliação a prevalência das alterações dérmicas em cães foi de 7,8%, as óticas de 4,2% e as oftálmicas de 3,3%. Dentro das alterações dérmicas, a principal suspeita etiológica por diagnóstico clínico foram os dermatófitos com 86,9%, nas alterações óticas foi Malassezia com 86,5% e para as oftálmicas foi Candida com 83,3%. A análise estatística das variáveis não apresentou associação com os sintomas ou com os agentes etiológicos diagnosticados clínicamente; embora, a avaliação categorizada evidenciou associações entre raças e idades com as etiologias por diagnóstico clínico. O diagnóstico das etiologias micóticas foi estabelecido na maioria dos casos pelos achados clínicos e, menos freqüentemente por raspados de pele e citologia ótica, em nenhum dos casos foi realizada uma cultura micótica. A população felina não apresentou alterações dérmicas, óticas e oftálmicas clinicamente compatíveis com etiologia fúngica. Conclusão. Em cães, a prevalência das alterações dérmicas clinicamente compatíveis com dermatófitos foi de 86,9%, os processos óticos associados com Malassezia foi de 86,5% e os oftálmicos suspeitos de Candida foi de 83,3%. Os diagnósticos definitivos foram estabelecidos pelos achados clínicos sem a realização de métodos diagnósticos padroes, como o cultivo...